Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP188Q5SRE5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP188Q5SRE5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP188Q5SRE5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUP188Q5SRE5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUP188Q5SRE5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUP188Q5SRE5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUP188Q5SRE5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUP188Q5SRE5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NUP188Q5SRE5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NUP188Q5SRE5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NUP188Q5SRE5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NUP188Q5SRE5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NUP188Q5SRE5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NUP188Q5SRE5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
NUP188Q5SRE5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP188Q5SRE5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NUP188Q5SRE5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms