Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAX1Q5SQQ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAX1Q5SQQ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms