Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV6

EXOSC6, Exosome complex component MTR3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC6Q5RKV6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC6Q5RKV6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC6Q5RKV6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC6Q5RKV6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms