Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC38Q502W7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC38Q502W7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC38Q502W7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms