Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
FHOD3Q2V2M9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
FHOD3Q2V2M9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
FHOD3Q2V2M9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
FHOD3Q2V2M9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
FHOD3Q2V2M9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
FHOD3Q2V2M9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
FHOD3Q2V2M9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
FHOD3Q2V2M9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
FHOD3Q2V2M9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
FHOD3Q2V2M9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
FHOD3Q2V2M9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
FHOD3Q2V2M9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
FHOD3Q2V2M9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
FHOD3Q2V2M9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
FHOD3Q2V2M9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
FHOD3Q2V2M9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
FHOD3Q2V2M9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
FHOD3Q2V2M9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.19■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
FHOD3Q2V2M9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC40.11■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.09■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC40.08■■■■■ 4.01
FHOD3Q2V2M9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC40.07■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC40.07■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.07■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms