Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHL40Q2TBA0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHL40Q2TBA0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KLHL40Q2TBA0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms