Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TSR1Q2NL82 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TSR1Q2NL82 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TSR1Q2NL82 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms