Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC142Q17RM4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC142Q17RM4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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