Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ANKRD1Q15327 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ANKRD1Q15327 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ANKRD1Q15327 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ANKRD1Q15327 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ANKRD1Q15327 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ANKRD1Q15327 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ANKRD1Q15327 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ANKRD1Q15327 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ANKRD1Q15327 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ANKRD1Q15327 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ANKRD1Q15327 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ANKRD1Q15327 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ANKRD1Q15327 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ANKRD1Q15327 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ANKRD1Q15327 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ANKRD1Q15327 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms