Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms