Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1D2Q14995 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1D2Q14995 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1D2Q14995 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms