Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RFTN1Q14699 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFTN1Q14699 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFTN1Q14699 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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