Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SMC1AQ14683 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMC1AQ14683 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC1AQ14683 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC1AQ14683 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC1AQ14683 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC1AQ14683 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC1AQ14683 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC1AQ14683 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMC1AQ14683 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SMC1AQ14683 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC1AQ14683 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC1AQ14683 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMC1AQ14683 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMC1AQ14683 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMC1AQ14683 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMC1AQ14683 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SMC1AQ14683 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMC1AQ14683 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SMC1AQ14683 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMC1AQ14683 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMC1AQ14683 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMC1AQ14683 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC1AQ14683 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC1AQ14683 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC1AQ14683 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC1AQ14683 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMC1AQ14683 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC1AQ14683 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC1AQ14683 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMC1AQ14683 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
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