Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CUL4AQ13619 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CUL4AQ13619 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CUL4AQ13619 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CUL4AQ13619 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
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