Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTA1Q13330 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MTA1Q13330 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTA1Q13330 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA1Q13330 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms