Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPS1Q13098 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPS1Q13098 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPS1Q13098 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
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