Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBL2Q08999 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBL2Q08999 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBL2Q08999 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBL2Q08999 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBL2Q08999 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBL2Q08999 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBL2Q08999 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBL2Q08999 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBL2Q08999 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBL2Q08999 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RBL2Q08999 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RBL2Q08999 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBL2Q08999 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RBL2Q08999 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBL2Q08999 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBL2Q08999 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBL2Q08999 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBL2Q08999 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBL2Q08999 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBL2Q08999 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBL2Q08999 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBL2Q08999 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBL2Q08999 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBL2Q08999 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1140.2 ms