Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXM1Q08050 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXM1Q08050 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXM1Q08050 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXM1Q08050 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXM1Q08050 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXM1Q08050 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXM1Q08050 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms