Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSBP1Q04837 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SSBP1Q04837 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSBP1Q04837 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SSBP1Q04837 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSBP1Q04837 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSBP1Q04837 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSBP1Q04837 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSBP1Q04837 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSBP1Q04837 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSBP1Q04837 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSBP1Q04837 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSBP1Q04837 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSBP1Q04837 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSBP1Q04837 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SSBP1Q04837 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSBP1Q04837 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSBP1Q04837 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSBP1Q04837 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSBP1Q04837 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSBP1Q04837 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSBP1Q04837 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSBP1Q04837 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSBP1Q04837 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSBP1Q04837 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SSBP1Q04837 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSBP1Q04837 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms