Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGFBR3Q03167 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFBR3Q03167 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms