Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SATB1Q01826 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SATB1Q01826 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms