Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCNA1P78396 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCNA1P78396 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCNA1P78396 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCNA1P78396 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCNA1P78396 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNA1P78396 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNA1P78396 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNA1P78396 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNA1P78396 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNA1P78396 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNA1P78396 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms