Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS28P62857 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS28P62857 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS28P62857 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS28P62857 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS28P62857 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS28P62857 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS28P62857 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS28P62857 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS28P62857 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS28P62857 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS28P62857 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS28P62857 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS28P62857 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS28P62857 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS28P62857 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS28P62857 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS28P62857 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS28P62857 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS28P62857 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS28P62857 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS28P62857 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS28P62857 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS28P62857 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS28P62857 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS28P62857 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS28P62857 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS28P62857 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS28P62857 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS28P62857 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS28P62857 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS28P62857 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS28P62857 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS28P62857 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS28P62857 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS28P62857 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS28P62857 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS28P62857 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS28P62857 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS28P62857 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS28P62857 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS28P62857 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS28P62857 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS28P62857 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS28P62857 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS28P62857 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS28P62857 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS28P62857 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS28P62857 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS28P62857 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS28P62857 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS28P62857 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS28P62857 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS28P62857 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS28P62857 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS28P62857 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS28P62857 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS28P62857 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS28P62857 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS28P62857 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS28P62857 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS28P62857 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS28P62857 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS28P62857 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS28P62857 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS28P62857 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS28P62857 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS28P62857 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS28P62857 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS28P62857 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS28P62857 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS28P62857 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS28P62857 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS28P62857 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS28P62857 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS28P62857 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS28P62857 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS28P62857 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS28P62857 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS28P62857 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS28P62857 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPS28P62857 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS28P62857 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS28P62857 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS28P62857 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS28P62857 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS28P62857 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS28P62857 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS28P62857 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS28P62857 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS28P62857 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS28P62857 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS28P62857 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS28P62857 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS28P62857 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS28P62857 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS28P62857 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS28P62857 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS28P62857 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS28P62857 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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