Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPZ1P61923 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPZ1P61923 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms