Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR4P61073 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR4P61073 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR4P61073 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.6 ms