Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms