Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCDC1P59894 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCDC1P59894 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCDC1P59894 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCDC1P59894 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCDC1P59894 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCDC1P59894 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCDC1P59894 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
DCDC1P59894 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCDC1P59894 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms