Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00205P59089 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00205P59089 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms