Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BP1P59074 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP4BP1P59074 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHMP4BP1P59074 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms