Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EEFSECP57772 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EEFSECP57772 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EEFSECP57772 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms