Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LBX1P52954 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LBX1P52954 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LBX1P52954 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LBX1P52954 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LBX1P52954 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LBX1P52954 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LBX1P52954 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LBX1P52954 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LBX1P52954 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LBX1P52954 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LBX1P52954 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LBX1P52954 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LBX1P52954 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LBX1P52954 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LBX1P52954 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LBX1P52954 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LBX1P52954 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LBX1P52954 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LBX1P52954 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LBX1P52954 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LBX1P52954 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LBX1P52954 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LBX1P52954 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LBX1P52954 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LBX1P52954 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LBX1P52954 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LBX1P52954 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LBX1P52954 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LBX1P52954 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LBX1P52954 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LBX1P52954 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LBX1P52954 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LBX1P52954 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LBX1P52954 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LBX1P52954 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LBX1P52954 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LBX1P52954 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LBX1P52954 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LBX1P52954 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LBX1P52954 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LBX1P52954 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LBX1P52954 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LBX1P52954 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LBX1P52954 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LBX1P52954 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LBX1P52954 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LBX1P52954 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LBX1P52954 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LBX1P52954 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LBX1P52954 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LBX1P52954 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LBX1P52954 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LBX1P52954 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LBX1P52954 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LBX1P52954 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LBX1P52954 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LBX1P52954 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LBX1P52954 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LBX1P52954 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LBX1P52954 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LBX1P52954 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LBX1P52954 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LBX1P52954 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LBX1P52954 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LBX1P52954 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LBX1P52954 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LBX1P52954 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LBX1P52954 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LBX1P52954 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LBX1P52954 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LBX1P52954 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LBX1P52954 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LBX1P52954 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LBX1P52954 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LBX1P52954 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LBX1P52954 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LBX1P52954 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LBX1P52954 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LBX1P52954 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LBX1P52954 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LBX1P52954 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LBX1P52954 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LBX1P52954 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LBX1P52954 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LBX1P52954 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LBX1P52954 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LBX1P52954 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LBX1P52954 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LBX1P52954 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LBX1P52954 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LBX1P52954 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LBX1P52954 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LBX1P52954 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LBX1P52954 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LBX1P52954 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LBX1P52954 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LBX1P52954 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LBX1P52954 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LBX1P52954 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms