Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDST2P52849 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDST2P52849 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDST2P52849 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDST2P52849 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDST2P52849 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDST2P52849 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDST2P52849 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDST2P52849 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDST2P52849 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDST2P52849 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDST2P52849 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDST2P52849 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDST2P52849 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDST2P52849 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDST2P52849 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDST2P52849 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDST2P52849 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDST2P52849 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDST2P52849 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDST2P52849 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NDST2P52849 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDST2P52849 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NDST2P52849 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDST2P52849 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDST2P52849 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDST2P52849 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NDST2P52849 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDST2P52849 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDST2P52849 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST2P52849 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST2P52849 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST2P52849 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST2P52849 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDST2P52849 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDST2P52849 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NDST2P52849 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NDST2P52849 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST2P52849 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST2P52849 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST2P52849 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST2P52849 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST2P52849 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST2P52849 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST2P52849 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST2P52849 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST2P52849 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST2P52849 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST2P52849 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST2P52849 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST2P52849 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST2P52849 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST2P52849 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST2P52849 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST2P52849 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST2P52849 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST2P52849 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDST2P52849 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDST2P52849 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDST2P52849 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDST2P52849 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDST2P52849 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDST2P52849 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDST2P52849 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDST2P52849 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NDST2P52849 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NDST2P52849 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDST2P52849 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDST2P52849 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST2P52849 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST2P52849 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST2P52849 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDST2P52849 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDST2P52849 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDST2P52849 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDST2P52849 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDST2P52849 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDST2P52849 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDST2P52849 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST2P52849 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST2P52849 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST2P52849 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST2P52849 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST2P52849 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST2P52849 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDST2P52849 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDST2P52849 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDST2P52849 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDST2P52849 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDST2P52849 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NDST2P52849 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDST2P52849 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NDST2P52849 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST2P52849 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST2P52849 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST2P52849 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST2P52849 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST2P52849 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDST2P52849 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDST2P52849 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms