Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEK4P51957 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEK4P51957 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEK4P51957 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEK4P51957 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NEK4P51957 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NEK4P51957 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEK4P51957 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEK4P51957 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEK4P51957 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEK4P51957 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEK4P51957 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEK4P51957 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEK4P51957 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEK4P51957 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEK4P51957 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEK4P51957 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEK4P51957 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEK4P51957 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEK4P51957 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEK4P51957 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEK4P51957 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEK4P51957 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEK4P51957 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEK4P51957 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEK4P51957 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEK4P51957 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEK4P51957 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEK4P51957 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEK4P51957 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NEK4P51957 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEK4P51957 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEK4P51957 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEK4P51957 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEK4P51957 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEK4P51957 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEK4P51957 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEK4P51957 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEK4P51957 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEK4P51957 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEK4P51957 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEK4P51957 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEK4P51957 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEK4P51957 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEK4P51957 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEK4P51957 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEK4P51957 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEK4P51957 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NEK4P51957 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEK4P51957 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEK4P51957 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEK4P51957 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEK4P51957 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEK4P51957 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEK4P51957 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEK4P51957 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEK4P51957 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEK4P51957 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEK4P51957 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEK4P51957 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEK4P51957 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEK4P51957 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEK4P51957 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEK4P51957 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEK4P51957 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEK4P51957 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEK4P51957 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEK4P51957 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEK4P51957 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEK4P51957 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEK4P51957 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEK4P51957 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEK4P51957 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEK4P51957 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEK4P51957 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEK4P51957 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEK4P51957 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEK4P51957 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEK4P51957 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEK4P51957 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NEK4P51957 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEK4P51957 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEK4P51957 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEK4P51957 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEK4P51957 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEK4P51957 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEK4P51957 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEK4P51957 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEK4P51957 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEK4P51957 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEK4P51957 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEK4P51957 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEK4P51957 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEK4P51957 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEK4P51957 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEK4P51957 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NEK4P51957 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEK4P51957 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NEK4P51957 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEK4P51957 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms