Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCNN1BP51168 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCNN1BP51168 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCNN1BP51168 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms