Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERFP50548 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERFP50548 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERFP50548 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERFP50548 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERFP50548 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERFP50548 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERFP50548 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERFP50548 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERFP50548 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERFP50548 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERFP50548 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERFP50548 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERFP50548 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERFP50548 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERFP50548 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ERFP50548 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERFP50548 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERFP50548 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERFP50548 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERFP50548 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERFP50548 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERFP50548 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERFP50548 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERFP50548 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERFP50548 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERFP50548 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERFP50548 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERFP50548 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERFP50548 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERFP50548 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERFP50548 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERFP50548 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERFP50548 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERFP50548 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERFP50548 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERFP50548 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERFP50548 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERFP50548 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERFP50548 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERFP50548 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERFP50548 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERFP50548 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERFP50548 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERFP50548 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERFP50548 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERFP50548 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERFP50548 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERFP50548 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERFP50548 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERFP50548 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERFP50548 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERFP50548 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERFP50548 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERFP50548 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERFP50548 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERFP50548 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERFP50548 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERFP50548 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERFP50548 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERFP50548 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERFP50548 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERFP50548 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERFP50548 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERFP50548 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERFP50548 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERFP50548 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERFP50548 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERFP50548 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERFP50548 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERFP50548 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERFP50548 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERFP50548 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERFP50548 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERFP50548 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERFP50548 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERFP50548 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERFP50548 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERFP50548 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERFP50548 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERFP50548 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERFP50548 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERFP50548 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERFP50548 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERFP50548 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERFP50548 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERFP50548 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERFP50548 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERFP50548 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERFP50548 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERFP50548 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERFP50548 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERFP50548 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERFP50548 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERFP50548 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERFP50548 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERFP50548 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERFP50548 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ERFP50548 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERFP50548 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms