Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CBP42338 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CBP42338 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PIK3CBP42338 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms