Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECI1P42126 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECI1P42126 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECI1P42126 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECI1P42126 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECI1P42126 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECI1P42126 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECI1P42126 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECI1P42126 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECI1P42126 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECI1P42126 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECI1P42126 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECI1P42126 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECI1P42126 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECI1P42126 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECI1P42126 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECI1P42126 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECI1P42126 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECI1P42126 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECI1P42126 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECI1P42126 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECI1P42126 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ECI1P42126 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECI1P42126 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECI1P42126 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECI1P42126 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECI1P42126 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECI1P42126 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECI1P42126 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECI1P42126 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECI1P42126 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECI1P42126 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECI1P42126 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECI1P42126 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECI1P42126 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECI1P42126 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECI1P42126 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECI1P42126 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECI1P42126 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECI1P42126 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECI1P42126 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECI1P42126 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECI1P42126 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECI1P42126 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECI1P42126 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECI1P42126 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECI1P42126 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECI1P42126 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECI1P42126 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECI1P42126 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECI1P42126 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECI1P42126 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECI1P42126 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECI1P42126 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECI1P42126 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECI1P42126 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ECI1P42126 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECI1P42126 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ECI1P42126 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECI1P42126 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECI1P42126 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECI1P42126 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECI1P42126 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECI1P42126 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECI1P42126 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECI1P42126 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECI1P42126 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECI1P42126 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECI1P42126 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECI1P42126 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ECI1P42126 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECI1P42126 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ECI1P42126 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECI1P42126 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ECI1P42126 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECI1P42126 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECI1P42126 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECI1P42126 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECI1P42126 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECI1P42126 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECI1P42126 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECI1P42126 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECI1P42126 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECI1P42126 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECI1P42126 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECI1P42126 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECI1P42126 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECI1P42126 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECI1P42126 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECI1P42126 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECI1P42126 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECI1P42126 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECI1P42126 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ECI1P42126 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ECI1P42126 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ECI1P42126 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECI1P42126 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECI1P42126 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECI1P42126 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECI1P42126 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms