Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBX1P40424 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBX1P40424 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PBX1P40424 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PBX1P40424 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBX1P40424 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PBX1P40424 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PBX1P40424 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PBX1P40424 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PBX1P40424 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX1P40424 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX1P40424 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX1P40424 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX1P40424 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PBX1P40424 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PBX1P40424 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PBX1P40424 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PBX1P40424 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PBX1P40424 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PBX1P40424 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PBX1P40424 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PBX1P40424 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX1P40424 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX1P40424 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX1P40424 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX1P40424 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX1P40424 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX1P40424 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX1P40424 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX1P40424 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PBX1P40424 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PBX1P40424 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PBX1P40424 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBX1P40424 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBX1P40424 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBX1P40424 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBX1P40424 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBX1P40424 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBX1P40424 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBX1P40424 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBX1P40424 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBX1P40424 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBX1P40424 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBX1P40424 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX1P40424 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX1P40424 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX1P40424 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX1P40424 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX1P40424 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX1P40424 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PBX1P40424 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PBX1P40424 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PBX1P40424 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PBX1P40424 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PBX1P40424 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PBX1P40424 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PBX1P40424 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PBX1P40424 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PBX1P40424 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX1P40424 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX1P40424 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX1P40424 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PBX1P40424 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PBX1P40424 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PBX1P40424 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PBX1P40424 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PBX1P40424 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PBX1P40424 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PBX1P40424 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PBX1P40424 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PBX1P40424 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX1P40424 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX1P40424 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX1P40424 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX1P40424 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX1P40424 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX1P40424 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PBX1P40424 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PBX1P40424 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PBX1P40424 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PBX1P40424 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PBX1P40424 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PBX1P40424 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PBX1P40424 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PBX1P40424 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PBX1P40424 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PBX1P40424 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PBX1P40424 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PBX1P40424 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PBX1P40424 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PBX1P40424 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PBX1P40424 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PBX1P40424 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PBX1P40424 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PBX1P40424 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PBX1P40424 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PBX1P40424 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBX1P40424 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBX1P40424 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBX1P40424 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms