Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP214P35658 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP214P35658 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP214P35658 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP214P35658 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP214P35658 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP214P35658 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP214P35658 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NUP214P35658 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP214P35658 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP214P35658 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP214P35658 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP214P35658 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP214P35658 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP214P35658 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP214P35658 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP214P35658 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP214P35658 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP214P35658 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP214P35658 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP214P35658 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP214P35658 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP214P35658 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP214P35658 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP214P35658 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP214P35658 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP214P35658 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP214P35658 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP214P35658 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP214P35658 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP214P35658 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP214P35658 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP214P35658 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP214P35658 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP214P35658 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP214P35658 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP214P35658 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP214P35658 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP214P35658 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP214P35658 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP214P35658 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP214P35658 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP214P35658 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP214P35658 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP214P35658 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP214P35658 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP214P35658 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP214P35658 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP214P35658 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP214P35658 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP214P35658 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP214P35658 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP214P35658 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP214P35658 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP214P35658 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP214P35658 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP214P35658 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP214P35658 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP214P35658 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP214P35658 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP214P35658 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP214P35658 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP214P35658 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP214P35658 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP214P35658 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP214P35658 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP214P35658 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP214P35658 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP214P35658 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP214P35658 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP214P35658 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP214P35658 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP214P35658 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP214P35658 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP214P35658 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP214P35658 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP214P35658 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP214P35658 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP214P35658 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP214P35658 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP214P35658 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP214P35658 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP214P35658 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP214P35658 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP214P35658 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP214P35658 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP214P35658 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP214P35658 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP214P35658 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP214P35658 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP214P35658 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP214P35658 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP214P35658 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP214P35658 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP214P35658 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP214P35658 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP214P35658 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP214P35658 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP214P35658 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP214P35658 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms