Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CPS1P31327 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CPS1P31327 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CPS1P31327 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CPS1P31327 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CPS1P31327 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CPS1P31327 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CPS1P31327 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CPS1P31327 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CPS1P31327 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CPS1P31327 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CPS1P31327 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CPS1P31327 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CPS1P31327 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CPS1P31327 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CPS1P31327 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CPS1P31327 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CPS1P31327 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CPS1P31327 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CPS1P31327 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CPS1P31327 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CPS1P31327 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CPS1P31327 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CPS1P31327 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CPS1P31327 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CPS1P31327 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CPS1P31327 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CPS1P31327 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CPS1P31327 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CPS1P31327 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CPS1P31327 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CPS1P31327 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CPS1P31327 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CPS1P31327 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CPS1P31327 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CPS1P31327 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CPS1P31327 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CPS1P31327 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CPS1P31327 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CPS1P31327 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CPS1P31327 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CPS1P31327 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CPS1P31327 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CPS1P31327 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CPS1P31327 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CPS1P31327 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CPS1P31327 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CPS1P31327 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CPS1P31327 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CPS1P31327 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CPS1P31327 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CPS1P31327 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CPS1P31327 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CPS1P31327 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CPS1P31327 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CPS1P31327 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CPS1P31327 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CPS1P31327 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CPS1P31327 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CPS1P31327 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CPS1P31327 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CPS1P31327 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CPS1P31327 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CPS1P31327 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CPS1P31327 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CPS1P31327 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CPS1P31327 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CPS1P31327 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CPS1P31327 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CPS1P31327 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CPS1P31327 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CPS1P31327 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CPS1P31327 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CPS1P31327 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CPS1P31327 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CPS1P31327 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CPS1P31327 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CPS1P31327 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CPS1P31327 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CPS1P31327 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CPS1P31327 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CPS1P31327 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CPS1P31327 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CPS1P31327 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CPS1P31327 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CPS1P31327 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CPS1P31327 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CPS1P31327 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CPS1P31327 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CPS1P31327 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CPS1P31327 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CPS1P31327 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CPS1P31327 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CPS1P31327 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CPS1P31327 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CPS1P31327 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CPS1P31327 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CPS1P31327 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CPS1P31327 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CPS1P31327 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms