Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD1CP29017 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD1CP29017 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD1CP29017 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD1CP29017 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CD1CP29017 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD1CP29017 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD1CP29017 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD1CP29017 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD1CP29017 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD1CP29017 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD1CP29017 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD1CP29017 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CD1CP29017 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD1CP29017 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD1CP29017 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD1CP29017 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD1CP29017 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD1CP29017 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD1CP29017 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD1CP29017 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD1CP29017 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD1CP29017 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD1CP29017 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD1CP29017 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CD1CP29017 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD1CP29017 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD1CP29017 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD1CP29017 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD1CP29017 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD1CP29017 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD1CP29017 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD1CP29017 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD1CP29017 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CD1CP29017 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD1CP29017 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD1CP29017 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD1CP29017 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD1CP29017 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD1CP29017 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD1CP29017 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD1CP29017 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD1CP29017 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD1CP29017 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD1CP29017 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CD1CP29017 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD1CP29017 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CD1CP29017 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD1CP29017 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD1CP29017 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD1CP29017 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD1CP29017 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD1CP29017 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD1CP29017 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD1CP29017 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD1CP29017 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD1CP29017 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD1CP29017 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD1CP29017 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD1CP29017 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD1CP29017 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD1CP29017 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD1CP29017 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CD1CP29017 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD1CP29017 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD1CP29017 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD1CP29017 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD1CP29017 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD1CP29017 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD1CP29017 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD1CP29017 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD1CP29017 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD1CP29017 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD1CP29017 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD1CP29017 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD1CP29017 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD1CP29017 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD1CP29017 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD1CP29017 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD1CP29017 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD1CP29017 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD1CP29017 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD1CP29017 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD1CP29017 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD1CP29017 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD1CP29017 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD1CP29017 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD1CP29017 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD1CP29017 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD1CP29017 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD1CP29017 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CD1CP29017 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD1CP29017 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD1CP29017 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD1CP29017 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CD1CP29017 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD1CP29017 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD1CP29017 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD1CP29017 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD1CP29017 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms