Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
S100A1P23297 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
S100A1P23297 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
S100A1P23297 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
S100A1P23297 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
S100A1P23297 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
S100A1P23297 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
S100A1P23297 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
S100A1P23297 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
S100A1P23297 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
S100A1P23297 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
S100A1P23297 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
S100A1P23297 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
S100A1P23297 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
S100A1P23297 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
S100A1P23297 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
S100A1P23297 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
S100A1P23297 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
S100A1P23297 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
S100A1P23297 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
S100A1P23297 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
S100A1P23297 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
S100A1P23297 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
S100A1P23297 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
S100A1P23297 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
S100A1P23297 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
S100A1P23297 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
S100A1P23297 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
S100A1P23297 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
S100A1P23297 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
S100A1P23297 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
S100A1P23297 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
S100A1P23297 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
S100A1P23297 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
S100A1P23297 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
S100A1P23297 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
S100A1P23297 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
S100A1P23297 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
S100A1P23297 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
S100A1P23297 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
S100A1P23297 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
S100A1P23297 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
S100A1P23297 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
S100A1P23297 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
S100A1P23297 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
S100A1P23297 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
S100A1P23297 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
S100A1P23297 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
S100A1P23297 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
S100A1P23297 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S100A1P23297 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S100A1P23297 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S100A1P23297 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S100A1P23297 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
S100A1P23297 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S100A1P23297 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S100A1P23297 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
S100A1P23297 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S100A1P23297 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S100A1P23297 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100A1P23297 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100A1P23297 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
S100A1P23297 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100A1P23297 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
S100A1P23297 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100A1P23297 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100A1P23297 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S100A1P23297 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S100A1P23297 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S100A1P23297 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S100A1P23297 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
S100A1P23297 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
S100A1P23297 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
S100A1P23297 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
S100A1P23297 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
S100A1P23297 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
S100A1P23297 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
S100A1P23297 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
S100A1P23297 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
S100A1P23297 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
S100A1P23297 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
S100A1P23297 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
S100A1P23297 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100A1P23297 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100A1P23297 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100A1P23297 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100A1P23297 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100A1P23297 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100A1P23297 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100A1P23297 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100A1P23297 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100A1P23297 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100A1P23297 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100A1P23297 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100A1P23297 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100A1P23297 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100A1P23297 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100A1P23297 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
S100A1P23297 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
S100A1P23297 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms