Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPRR1BP22528 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1BP22528 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1BP22528 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1BP22528 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1BP22528 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1BP22528 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1BP22528 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1BP22528 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1BP22528 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1BP22528 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1BP22528 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1BP22528 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1BP22528 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRR1BP22528 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRR1BP22528 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPRR1BP22528 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRR1BP22528 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPRR1BP22528 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPRR1BP22528 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRR1BP22528 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPRR1BP22528 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPRR1BP22528 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPRR1BP22528 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPRR1BP22528 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPRR1BP22528 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPRR1BP22528 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPRR1BP22528 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPRR1BP22528 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPRR1BP22528 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPRR1BP22528 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPRR1BP22528 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPRR1BP22528 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPRR1BP22528 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPRR1BP22528 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPRR1BP22528 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRR1BP22528 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRR1BP22528 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRR1BP22528 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRR1BP22528 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPRR1BP22528 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRR1BP22528 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRR1BP22528 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRR1BP22528 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRR1BP22528 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRR1BP22528 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRR1BP22528 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRR1BP22528 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRR1BP22528 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRR1BP22528 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRR1BP22528 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRR1BP22528 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms