Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRM3P20309 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM3P20309 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms