Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN8P19075 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN8P19075 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN8P19075 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms