Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPI1P17947 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPI1P17947 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPI1P17947 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPI1P17947 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPI1P17947 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPI1P17947 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPI1P17947 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPI1P17947 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPI1P17947 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPI1P17947 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPI1P17947 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPI1P17947 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPI1P17947 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPI1P17947 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPI1P17947 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPI1P17947 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPI1P17947 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPI1P17947 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPI1P17947 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPI1P17947 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPI1P17947 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPI1P17947 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPI1P17947 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPI1P17947 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPI1P17947 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPI1P17947 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPI1P17947 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPI1P17947 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPI1P17947 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPI1P17947 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPI1P17947 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPI1P17947 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPI1P17947 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPI1P17947 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPI1P17947 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPI1P17947 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPI1P17947 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPI1P17947 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPI1P17947 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPI1P17947 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPI1P17947 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPI1P17947 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPI1P17947 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPI1P17947 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPI1P17947 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPI1P17947 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPI1P17947 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPI1P17947 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPI1P17947 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPI1P17947 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPI1P17947 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPI1P17947 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPI1P17947 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPI1P17947 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPI1P17947 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPI1P17947 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPI1P17947 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPI1P17947 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPI1P17947 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPI1P17947 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPI1P17947 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPI1P17947 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPI1P17947 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPI1P17947 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPI1P17947 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPI1P17947 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPI1P17947 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPI1P17947 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPI1P17947 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPI1P17947 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPI1P17947 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPI1P17947 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPI1P17947 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPI1P17947 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPI1P17947 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPI1P17947 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPI1P17947 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPI1P17947 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPI1P17947 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPI1P17947 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPI1P17947 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPI1P17947 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPI1P17947 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPI1P17947 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPI1P17947 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPI1P17947 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPI1P17947 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPI1P17947 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPI1P17947 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPI1P17947 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPI1P17947 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPI1P17947 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPI1P17947 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPI1P17947 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPI1P17947 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPI1P17947 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPI1P17947 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPI1P17947 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPI1P17947 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms