Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEP16870 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEP16870 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEP16870 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEP16870 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEP16870 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEP16870 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEP16870 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEP16870 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEP16870 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEP16870 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEP16870 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEP16870 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEP16870 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEP16870 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEP16870 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPEP16870 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPEP16870 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPEP16870 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPEP16870 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPEP16870 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEP16870 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEP16870 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEP16870 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEP16870 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEP16870 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEP16870 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEP16870 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEP16870 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEP16870 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEP16870 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEP16870 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEP16870 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEP16870 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEP16870 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEP16870 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEP16870 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEP16870 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEP16870 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEP16870 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPEP16870 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPEP16870 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPEP16870 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEP16870 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEP16870 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEP16870 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEP16870 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEP16870 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEP16870 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEP16870 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEP16870 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEP16870 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEP16870 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEP16870 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEP16870 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEP16870 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPEP16870 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPEP16870 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPEP16870 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPEP16870 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEP16870 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEP16870 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEP16870 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEP16870 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEP16870 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEP16870 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEP16870 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEP16870 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEP16870 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEP16870 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEP16870 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEP16870 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPEP16870 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEP16870 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEP16870 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEP16870 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEP16870 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEP16870 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEP16870 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEP16870 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEP16870 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEP16870 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPEP16870 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPEP16870 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPEP16870 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPEP16870 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPEP16870 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPEP16870 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPEP16870 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPEP16870 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPEP16870 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPEP16870 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPEP16870 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPEP16870 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPEP16870 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEP16870 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEP16870 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEP16870 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEP16870 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEP16870 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms