Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNMA6AP0CW24 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA6AP0CW24 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA6AP0CW24 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms