Protein–RNA interactions for Protein: P0C263

SBK2, Serine/threonine-protein kinase SBK2, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK2P0C263 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms