Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS17P08708 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS17P08708 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS17P08708 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS17P08708 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS17P08708 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS17P08708 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS17P08708 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS17P08708 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS17P08708 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS17P08708 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS17P08708 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS17P08708 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS17P08708 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS17P08708 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS17P08708 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS17P08708 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS17P08708 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS17P08708 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS17P08708 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS17P08708 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS17P08708 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS17P08708 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS17P08708 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS17P08708 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS17P08708 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS17P08708 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS17P08708 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS17P08708 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS17P08708 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS17P08708 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS17P08708 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS17P08708 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS17P08708 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS17P08708 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS17P08708 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS17P08708 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS17P08708 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS17P08708 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS17P08708 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS17P08708 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS17P08708 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS17P08708 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS17P08708 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS17P08708 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS17P08708 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS17P08708 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS17P08708 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS17P08708 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS17P08708 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS17P08708 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS17P08708 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS17P08708 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS17P08708 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS17P08708 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS17P08708 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS17P08708 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS17P08708 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS17P08708 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS17P08708 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS17P08708 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS17P08708 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS17P08708 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS17P08708 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS17P08708 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS17P08708 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS17P08708 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS17P08708 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS17P08708 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS17P08708 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS17P08708 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS17P08708 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS17P08708 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS17P08708 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS17P08708 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS17P08708 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS17P08708 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS17P08708 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS17P08708 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS17P08708 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS17P08708 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS17P08708 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS17P08708 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS17P08708 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS17P08708 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS17P08708 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS17P08708 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS17P08708 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS17P08708 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS17P08708 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS17P08708 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS17P08708 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS17P08708 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS17P08708 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS17P08708 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS17P08708 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS17P08708 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS17P08708 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS17P08708 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS17P08708 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms